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李虹 研究员

中国科学院上海营养与健康研究所

李虹 研究员

中国科学院上海营养与健康研究所

李虹‌是中国科学院上海营养与健康研究所研究员、博士生导师,主要致力于‌计算生物学‌与‌系统生物学‌研究,特别是在生物信息学算法开发及肿瘤系统生物学领域具有深厚造诣。


基本信息与教育背景

‌现任职务‌:中国科学院上海营养与健康研究所研究员、博导,曾任计算生物学第二党支部书记、所妇委会副主任等职。

‌教育经历‌:2001年至2005年就读于中南大学信息与计算科学专业(理学学士);2005年至2010年在中国科学院上海生命科学研究院攻读理学博士。

‌工作经历‌:博士毕业后赴美国系统生物学研究所从事博士后研究(2010-2013),回国后历任中科院上海生命科学研究院助理研究员、副研究员,2019年12月起任中国科学院上海营养与健康研究所研究员。‌‌

研究方向与学术贡献

李虹的研究特色在于‌生物信息学(IT)与生命科学(BT)的交叉融合‌,擅长从系统视角解决复杂的生物医学问题。


‌核心研究领域‌:


‌计算生物学与生物信息学‌:聚焦单细胞时空组学、人工智能算法在生物医学中的应用。

‌肿瘤系统生物学‌:重点研究肝癌个体化用药智能分析、肝损伤再生机制、胰腺癌肝转移以及慢性脂肪肝炎向肝癌转化的机理。

‌多组学数据分析框架开发‌:近期团队开发了基于可解释深度学习的单细胞多组学分析框架‌scMagnify‌,用于解析细胞命运决定中的多尺度动态基因调控,相关成果发表于《Nature Communications》。‌‌

‌代表性成果‌:


获得国家自然科学基金优秀青年项目资助。

荣获上海市科技系统“青年五四奖章”、“三八红旗手”荣誉称号。

研究成果曾入选“中国生物信息学十大应用”。‌


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